抽薹开花是大白菜从营养生长转到生殖生长的重要标志。在结球大白菜生产中,未熟抽薹会影响叶球的产量和质量,选育耐抽薹品种是其重要的育种目标;对于以花薹为产品器官的白菜薹来说,适时抽薹又是影响其产量形成的重要因素。揭示大白菜抽薹开花的分子机制,对于其遗传改良有重要意义。
近日,Theoretical and Applied Genetics在线发表了沈阳农业大学冯辉教授团队题为“Role of BrSDG8 on bolting in Chinese cabbage (Brassica rapa)”的研究论文。通过EMS诱变萌动种子,创制出13份稳定遗传的早抽薹突变体。选择其中的2份等位突变体ebm5-1和ebm5-2,开展了突变基因定位克隆研究,发现组蛋白甲基转移酶基因BrSDG8在调控大白菜抽薹开花上起重要作用。
该研究采用BSR-seq技术,分别将Brebm5-1和Brebm5-2定位到A07染色体的一个重叠区域,验证Brebm5-1和Brebm5-2属于等位突变基因。利用SSR和InDel标记,最终将Brebm5-1精细定位在A07染色体56.24 Kb区间。将突变体ebm5-1及其野生型ʻFTʼ全基因组重测序,发现突变体ebm5-1在定位区间内有一个非同义SNP,位于BraA07g040740.3C基因第17外显子上。克隆等位突变体ebm5-2的BraA07g040740.3C基因全长,发现其第12外显子上存在一个SNP,因此,确定BraA07g040740.3C为突变体的候选基因。BraA07g040740.3C为拟南芥SDG8的同源基因,编码一种具有组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶活性的蛋白质,在FLC染色质H3-K4三甲基化中起要作用。该研究结果证明了SDG8在大白菜抽薹调控网络中占据重要地位。
沈阳农业大学博士研究生富薇为论文第一作者,冯辉教授为通讯作者,蔬菜遗传育种与生物技术团队的刘志勇副教授和黄胜楠博士参加部分研究工作。该项研究得到了国家自然科学基金重点项目的资助。
https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-020-03647-4